檵木(Loropetalum chinense)是喀斯特地区(特别是漓江流域)植被恢复的关键树种。其变种红花檵木因独特的紫红色叶片与花朵,兼具高观赏价值与经济价值。然而,两者在叶绿体基因组层面的分化机制尚未明确。近期,我院进化生物学团队成功完成了檵木及其两个不同花色红花檵木栽培品种的完整叶绿体基因组组装。通过系统比较,阐明了檵木及其变种的叶绿体基因组结构特征、变异模式及进化动力,为后续的分子鉴定、系统发育及适应性进化研究奠定了遗传学基础。研究发现,在‘浅粉’品种中,RNA聚合酶β亚基编码基因(rpoB)存在一个独特的14 bp微倒位。该倒位导致五个氨基酸替换,并检测到显著的正选择信号,可能影响了编码蛋白的二级结构。 这一发现对理解该基因的功能演化具有重要意义,值得深入探索。本研究增进了对檵木属植物叶绿体基因组进化规律的认识,所鉴定的变异位点为该物种群的遗传多样性评估、分子鉴定及谱系地理学研究提供了关键的基因组资源。

图1 檵木叶绿体基因组图谱
相关成果以题为“Comparative analysis of chloroplast genomes of Loropetalum chinense and its purplish-red-flowered variety”的论文形式,在线发表于基因组学领域期刊《Functional & Integrative Genomics》(中科院二区)。广西师范大学珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室为第一完成单位。我院2023级生物学专业硕士研究生陈丽琳为论文第一作者,张志勇教授与李惠敏副教授为共同通讯作者,宋钰教授也参与了研究工作。该研究获广西科技基地和人才专项—高层次创新人才和团队培养项目(2024AC43009)资助。
论文链接: https://doi.org/10.1007/s10142-025-01767-y

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